数控系统由各独立功能模块组成，各个模块上都有许多开关、跳线和旋钮等以适应不同的功能要求。如在伺服驱动板中有用于调节系统开环增益和零点漂移的旋钮。在未知此类旋钮作用的情况下，调节任何一个旋钮的位置都会对数控系统造成损害。而且此类破坏，不易发现，会对后续维修造成障碍。
电路板物理破坏主要是指在电路板元件级维修中人为造成的电子器件损害、电路板断裂等现象。现代数控系统都由大规模集成电路组成，维修中集成电路对高压静电的释放十分敏感，各种合成化纤材料如橡胶鞋底、人造地板、地毯等都会在人体上产生几千伏的静电，会造成CMOS器件的损坏或者CMOS RAM数据丢失，甚至造成印刷电路板导线烧毁。另外，由于大规模集成电路的需要，数控系统的电路板往往都做成四层甚至更高的电路板层数，在采用置换法维修时频繁安装和调整电路板，会使电路板受力弯曲致使内层导线断裂。这种故障的维修往往需要专业的检测设备才能完成，维修的难度增加。
另外，其他形式的二次破坏如接线不牢、焊点虚焊、元件安装错位等在数控机床维修中也是应该十分警惕的。
三、二次破坏的严重性
二次破坏后果往往十分严重，故障排除困难，周期长，工作量大。
例如我国在20世纪80年代末分批次花巨资引进了多台意大利Mandelli五面体加工中心，数控系统为Mandelli公司早期自主开发的以工业小型计算机为核心的系统，已不再生产，当系统运行不正常时，常常没有较好的解决方案。如某企业该型号机床数控系统启动后，黑屏，但继电器柜等其他部分得电后都能正常启动。对系统键盘以及机床控制面板操作时，机床无任何反应。询问企业维修人员得知，该机床已先后被企业自备维修人员和其他企业维修人员维修多次，问题依然存在。经笔者全面检查发现系统电源有故障，更换电源电路板元器件后，电源正常，然而系统仍然不能正常启动。由于无完整的资料，只好对数控系统主机硬件结构进行解剖检查，发现主机菊花链中断系统的输出端被短接。结合小型计算机硬件特征和计算机中断工作模式特点以及数控机床开机后呈现的特点，初步判断该处短接线被“人为”短接。恢复正确跳线位置，系统重新启动后恢复正常运行，问题排除。
某企业所使用的CK6150的数控车床由于数控系统某块电路板上保险管卡簧折断，机床运行时的机械振动造成保险管接触不良，机床出现间歇式停刀，损害被加工工件。该机床经多次维修后，故障未被排除。多次维修使得控制系统接线混乱，外置PLC程序丢失，伺服系统损坏，二次破坏严重。经更换伺服系统，重新编制PLC程序和布线，更换保险管装置后系统恢复正常。然而维修的工作量却大大增加，维修持续时间长，对企业的生产也造成一定的负面影响。可编程控制器由于抗干扰能力强，可靠性高，编程简单，性能价格比高，在工业控制领域得到越来越广泛应用。
中央控制单元和下位机PLC之间采用串行通讯方式进行数据交换，通常距离在1000m以内选用485双绞线通讯方式，较常距离可选用光纤通讯，更长距离也可选用无线通讯方式。下位机选用PLC控制，根据控制对象的多少，控制对象的范围，可选用一台或多台PLC进行控制，PLC之间数据交换是利用内部链接寄存器，实现数据交换和共享。由于PLC对现场进实时监控具有很高的可靠性，且编程简单、灵活，因此越来越受到人们重视。
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